南京建工科研平台建设始于2007年，2009年通过省级企业技术中心认定，截至2019年，集团已拥有省级建筑企业技术中心1家、南京市装配式建筑工程研究中心1家、下设十余家专项研发中心，为省级研究生工作站、国家级博士后工作站。

为了突破企业发展的瓶颈，集团在2013年根据集团整体战略发展规划要求，整合现有的研发资源，组建了南京建工集团研究院，与高校、科研院所高度融合、深度合作，作为高校的研究生培养基地联合研发，在超高性能材料、装配式建筑、BIM、绿色施工、深基坑等领域打造核心技术，共同打造先进协同研发平台和高水准学术团队，实现最大程度上的科研资源共享，为企业转型升级提供助力。